В Кремле в торжественной обстановке Андрею Клишасу была вручена медаль ордена «За заслуги перед Отечеством» II степени. Указ № 1492 «О награждении государственными наградами Российской Федерации» был подписан президентом РФ Дмитрием Медведевым 17 октября 2008 года.

Вручая высокую награду, руководитель администрации президента Российской Федерации Сергей Нарышкин отметил выдающиеся заслуги Андрея Клишаса в развитии российской экономики, достигнутые трудовые успехи и его многолетнюю добросовестную работу.